| 专利号 | 2023104494118 | 申请日 | 2023-04-25 | 专利名称 | 基于改进strobemer的基因序列生成方法及系统 |
| 授权日 | 2023-08-18 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 刘卫国;李金津;殷泽坤 |
| 主分类号 | G16B35/10 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明公开了一种基于改进strobemer的基因序列生成方法及系统，涉及生物基因序列数据处理技术领域，该方法包括：针对每条碱基序列，从碱基序列的第一个碱基字符的位置开始，生成strobe序列，并进行合法性判断，若判断为合法，则基于hash函数计算合法strobe序列的hash值并保存；依次对碱基序列中的前n‑k+1个碱基字符循环上述生成序列的过程；以每个合法strobe序列为起始序列，调取所保存的hash值，利用改进的chop_X函数选取strobe序列，构建strobemer。本发明采用多线程并行处理，通过先进行合法性判断及hash值计算，避免冗余的判断和计算，提高处理效率。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业 生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||
