| 专利号 | 2017101504184 | 申请日 | 2017-03-14 | 专利名称 | 一种基于多重进化矩阵的蛋白质二级结构预测方法 |
| 授权日 | 2019-02-26 | 专利权人 | 齐鲁工业大学 | 发明人 | 鹿文鹏;杜月寒;刘毅慧;成金勇;孟凡擎 |
| 主分类号 | G16B30/00 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明公开了一种基于多重进化矩阵的蛋白质二级结构预测方法,包括:下载蛋白质NR数据库及BLAST程序本地软件包,生成给定蛋白质序列的位置特异性打分矩阵PSSM矩阵,对PSI‑BLAST程序进行参数调整得到蛋白质序列的不同趋异度的进化矩阵;对进化矩阵中的所有特征向量进行处理,构成多重进化矩阵特征;将多重进化矩阵的特征作为分类器的输入并对分类准确率进行评价,获得优化模型;针对结构未知的蛋白质,输入优化模型,预测蛋白质的二级结构。本发明对于一条蛋白质序列,同时使用多种不同进化趋异度的矩阵来表示蛋白质序列,更为充分的表示了蛋白质结构信息,更全面的考虑了残基替换的可能性,提高了蛋白质二级结构预测的准确率,编码方法简单有效。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业  生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||