专利号 | 2022100692350 | 申请日 | 2022-01-21 | 专利名称 | 一种基于参考基因组的转录本组装方法 |
授权日 | 2025-04-11 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 赵晓宇;于婷;姚鸿彬;李国君 |
主分类号 | G16B20/00 | 关键词 | 应用领域 | ||
摘要 | 本发明公开了一种基于参考基因组的转录本组装方法,属于生物信息学中的转录本组装领域,具体步骤为:(一)利用至少两个比对工具对下机得到的原始测序数据进行分析;(二)针对每一个比对工具的回帖结果构建剪接图;(三)合并每个比对工具的剪接图,生成标签剪接图;(四)提取标签图中标记的双端子路;(五)在标签剪接图中寻找路的覆盖,最终获得代表转录本的路覆盖,其中所有的双端路径都被完成组装的转录本覆盖。本发明的方法合并了不同比对工具的回帖结果,并以不同比对工具的回帖结果为基础构建了标签剪接图,通过动态路径扩展算法遍历图,从而找出表示转录本的路径,考虑了不同比对工具的特点和优势,提高重构出的转录本的准确率。 | ||||
创新点 | |||||
技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业  生物医学工程产业 | ||
运营方式 | 合作方式 | ||||
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