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专利号 2022100692350 申请日 2022-01-21 专利名称 一种基于参考基因组的转录本组装方法
授权日 2025-04-11 专利权人 山东大学 发明人 赵晓宇;于婷;姚鸿彬;李国君
主分类号 G16B20/00 关键词 应用领域
摘要 本发明公开了一种基于参考基因组的转录本组装方法,属于生物信息学中的转录本组装领域,具体步骤为:(一)利用至少两个比对工具对下机得到的原始测序数据进行分析;(二)针对每一个比对工具的回帖结果构建剪接图;(三)合并每个比对工具的剪接图,生成标签剪接图;(四)提取标签图中标记的双端子路;(五)在标签剪接图中寻找路的覆盖,最终获得代表转录本的路覆盖,其中所有的双端路径都被完成组装的转录本覆盖。本发明的方法合并了不同比对工具的回帖结果,并以不同比对工具的回帖结果为基础构建了标签剪接图,通过动态路径扩展算法遍历图,从而找出表示转录本的路径,考虑了不同比对工具的特点和优势,提高重构出的转录本的准确率。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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