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专利号 2021110971702 申请日 2021-09-18 专利名称 染色体三维结构重建方法及装置
授权日 2022-06-10 专利权人 山东财经大学 发明人 李防震
主分类号 G16B15/00 关键词 应用领域
摘要 本发明公开了一种染色体三维结构重建方法,包括以下步骤:将Hi‑C相互作用频率矩阵转化为距离矩阵D0;将距离矩阵D0补全,得到补全后的距离矩阵D1;按以下方法迭代求解染色体三维结构:步骤1、根据距离矩阵D1求解染色体三维结构S;步骤2、根据各基因组位点的空间位置计算出染色体三维结构S的固有距离矩阵D2;步骤3、利用D2D1进行修正,得到新的D1并转至步骤1;步骤4、满足预设条件后停止迭代并输出当前的染色体三维结构S。本发明还公开了一种染色体三维结构重建装置。本发明在ShRec3D算法基础上进行改进,利用重建出的染色体三维结构的固有距离矩阵对补全后距离矩阵进行迭代修正,从而在保持重建速度优势的前提下,大幅提高重建精度。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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