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专利号 2021111921077 申请日 2021-10-13 专利名称 基于多视图深度学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法
授权日 2024-06-11 专利权人 山东大学 发明人 魏乐义;庞超;龙文韬
主分类号 G16B5/00 关键词 应用领域
摘要 本发明提供一种基于多视图深度学习的化合物‑蛋白质相互作用预测方法,属于生物信息处理技术领域,提取的蛋白质的序列特征以及化合物的结构特征进行编码融合,获得表征化合物和蛋白质间相互作用的相关性信息的统一特征;利用预先训练好的预测模型,对序列特征、结构特征以及统一特征进行处理,得到蛋白质和化合物是否会发生相互作用的结果。本发明充分提取了蛋白质和化合物的特征信息,使用GNN来提取化合物的结构特征;获取蛋白质和化合物的潜在交互信息,从不同视角的特征空间生成统一特征;将BERT‑CNN的蛋白质信息、GNN获得的化合物信息和统一信息结合,作为下游预测的输入,保持了蛋白质和化合物的原始信息,化合物‑蛋白质相互作用预测结果更加准确。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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【关 闭】