| 专利号 | 2023116765498 | 申请日 | 2023-12-08 | 专利名称 | 一种基于多线程计算的生物序列比对方法及系统 |
| 授权日 | 2024-03-19 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 殷泽坤;陈冉;闫立峰;刘卫国 |
| 主分类号 | G16B30/10 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明属于生物序列比对技术领域，提供了一种基于多线程计算的生物序列比对方法及系统，其技术方案为：基于原有OrderMinHash算法，通过优化编译参数、调用RabbitFx库快速解析FASTA文件、交换算法循环顺序优化访存、转换数据类型使用按位函数、优先队列等优化计算、使用AVX512指令集充分利用SIMD向量处理单元提升计算效率等优化单线程模型，并设计多线程计算模型，允许控制线程数，且通过负载均衡等方式保证加速比与线程数基本成正比，完成算法在通用多核计算平台上的优化。解决了传统方法序列对比效率低的问题。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业 生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||
