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专利号 2023117637923 申请日 2023-12-21 专利名称 一种单细胞转录组测序数据插补方法
授权日 2024-03-08 专利权人 齐鲁工业大学(山东省科学院) 发明人 董祥军;董淑杰;赵龙;鹿文鹏
主分类号 G16B20/20 关键词 应用领域
摘要 本发明公开了一种单细胞转录组测序数据插补方法,涉及单细胞RNA测序数据处理领域。本发明包括以下步骤:S1:构建原始基因表达矩阵V,并对其进行归一化处理;S2:识别原始基因表达矩阵V中潜在的缺失值,构建系数矩阵P;S3:利用非负矩阵分解算法分解原始基因归一化矩阵,得到细胞潜在特征矩阵Q和基因潜在特征矩阵H,并分别对其进行L1正则化约束,而后对细胞潜在特征矩阵Q应用图正则化约束,而后,迭代更新细胞潜在特征矩阵Q和基因潜在特征矩阵H,直至收敛,得预测矩阵N;S4:获取插补后的矩阵。本发明所述方法插补后的测序数据,在下游的细胞聚类和细胞轨迹重建领域均有较佳表现。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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