| 专利号 | 2022100241623 | 申请日 | 2022-01-11 | 专利名称 | 一种基于XGBoost的DNA重组位点预测方法 |
| 授权日 | 2022-05-27 | 专利权人 | 山东建筑大学 | 发明人 | 刘振栋;陈曦;戴琼海;李冬雁;吕欣荣;杨玉荣;秦梦颖;柏苛;李晓峰;季向阳;刘烨斌;张伟;胡国胜;刘芳含;魏珑 |
| 主分类号 | G16B20/30 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明涉及计算生物学领域，主要是关于一种DNA重组位点的预测方法，特别是涉及到一种基于XGBoost的DNA重组位点预测方法，包括：根据初始数据集的样本对数据进行预处理，平衡正负样本；构建初始XGBoost回归预测模型；利用Optuna框架和平衡后的数据集进行模型的参数寻优；训练优化后的XGBoost回归预测模型；构建评价指标对模型的性能进行评价；根据模型得分的合理判断，对模型进行处理，直到获得稳定的高精度模型；最后输出预测位点的重组率，并经过特征重要性度量为特征打分，输出特征得分图。本发明可移植性好，预测效率高；可以发现尚未知晓的对重组起作用的特征，可以有效改进合成位点的设计方法，提高重组率；具有高度的灵活性和可扩展性。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业 生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||
