| 专利号 | 2026100556710 | 申请日 | 2026-01-16 | 专利名称 | 一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法 |
| 授权日 | 2026-03-20 | 专利权人 | 烟台大学 | 发明人 | 权威;吕金硕;张善儒;刘壮;卢志婷;庄名轩;朱晓;刘雯 |
| 主分类号 | G16B30/10 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明涉及基因序列比对技术领域,具体为一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法;本发明方法首先基于分频降权的加权syncmer采样对参考泛基因组图的segment进行处理,过滤高频冗余k‑mer、保留高特异性k‑mer,再构建哈希索引实现查询序列k‑mer的快速匹配,并生成候选锚点数组,大幅减少错误匹配、提升比对效率;然后,基于泛基因组图的拓扑信息,通过回溯计算筛选最佳线性链并进一步扩展为最佳图链,分层筛选策略降低了复杂图结构的搜索复杂度;最后,整合候选泛基因组图链集合输出比对结果,保障了结果的高精度与完整性,能够实现了对复杂拓扑结构泛基因组图的高效准确比对。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业  生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||