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专利号 2026100556710 申请日 2026-01-16 专利名称 一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法
授权日 2026-03-20 专利权人 烟台大学 发明人 权威;吕金硕;张善儒;刘壮;卢志婷;庄名轩;朱晓;刘雯
主分类号 G16B30/10 关键词 应用领域
摘要 本发明涉及基因序列比对技术领域,具体为一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法;本发明方法首先基于分频降权的加权syncmer采样对参考泛基因组图的segment进行处理,过滤高频冗余k‑mer、保留高特异性k‑mer,再构建哈希索引实现查询序列k‑mer的快速匹配,并生成候选锚点数组,大幅减少错误匹配、提升比对效率;然后,基于泛基因组图的拓扑信息,通过回溯计算筛选最佳线性链并进一步扩展为最佳图链,分层筛选策略降低了复杂图结构的搜索复杂度;最后,整合候选泛基因组图链集合输出比对结果,保障了结果的高精度与完整性,能够实现了对复杂拓扑结构泛基因组图的高效准确比对。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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