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专利号 2022104658999 申请日 2022-04-29 专利名称 一种蛋白质多源特征融合的药物-靶点亲和力预测的方法
授权日 2024-12-20 专利权人 中国海洋大学 发明人 魏志强;马文健;张树刚
主分类号 G16B15/30 关键词 应用领域
摘要 本发明公布了一种蛋白质多源特征融合的药物‑靶点亲和力预测的方法,首先通过构建PPI网络、SSN网络,并从该网络中提取蛋白特征,然后收集亚细胞位置、序列编码、功能位点、结构域等蛋白质特征,用于蛋白质表征;接着利用变分图自编码器融合多源特征,最后结合药物分支,并输入到全连接层中进行亲和力预测。本发明构建了PPI网络、SSN网络,从而使得本发明在关注靶点蛋白特征之外,还学习到靶点蛋白和其他蛋白之间的生物学先验知识;本发明首次从蛋白质相互作用、序列相似性、蛋白质亚细胞位置方面提取并融合蛋白质特征,以预测药物‑靶点亲和力,提高了预测准确率;此外,本发明中蛋白质的特征来源不包括蛋白质结构,从而摒弃了对蛋白质结构的依赖性。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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