| 专利号 | 2020110908742 | 申请日 | 2020-10-13 | 专利名称 | 面向多核处理器的基因变异检测方法及系统 |
| 授权日 | 2023-02-03 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 刘卫国;张浩;宋红磊;殷泽坤 |
| 主分类号 | G16B20/20 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明公开了面向多核处理器的基因变异检测方法,包括:对输入数据进行预处理;从预处理后得到的测序序列read提取简要比对信息表达式CIGAR信息;输入数据,是指:将待查询序列与参考序列进行比对得到的文件;对读取的测序序列read的简要比对信息表达式CIGAR信息进行修改;对修改后的测序序列read的简要比对信息表达式CIGAR信息进行处理,处理过程中从内存池中进行候选变异数据的调取,得到候选变异集合;对候选变异集合中变异的基因进行局部重比对,以降低假阳性变异的检测;对局部重比对后的变异的基因进行格式化处理,将格式化处理后的变异基因输出到输出文件中,并且将内存池中数据进行重置以便进行反复的使用。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业  生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||