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专利号 2020110908742 申请日 2020-10-13 专利名称 面向多核处理器的基因变异检测方法及系统
授权日 2023-02-03 专利权人 山东大学 发明人 刘卫国;张浩;宋红磊;殷泽坤
主分类号 G16B20/20 关键词 应用领域
摘要 本发明公开了面向多核处理器的基因变异检测方法,包括:对输入数据进行预处理;从预处理后得到的测序序列read提取简要比对信息表达式CIGAR信息;输入数据,是指:将待查询序列与参考序列进行比对得到的文件;对读取的测序序列read的简要比对信息表达式CIGAR信息进行修改;对修改后的测序序列read的简要比对信息表达式CIGAR信息进行处理,处理过程中从内存池中进行候选变异数据的调取,得到候选变异集合;对候选变异集合中变异的基因进行局部重比对,以降低假阳性变异的检测;对局部重比对后的变异的基因进行格式化处理,将格式化处理后的变异基因输出到输出文件中,并且将内存池中数据进行重置以便进行反复的使用。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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【关 闭】