| 专利号 | 2024111944104 | 申请日 | 2024-08-29 | 专利名称 | 基于层次图和几何向量感知器的蛋白质位点预测方法 |
| 授权日 | 2024-11-05 | 专利权人 | 中国石油大学(华东) | 发明人 | 宋弢;王珣;王爽;丁洪震;韩佩甫 |
| 主分类号 | G16B20/30 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明涉及生物信息学领域，特别是涉及基于层次图和几何向量感知器的蛋白质位点预测方法，RAGVP‑PPIS模型构建了一个综合了残基层次和原子层次的蛋白质图，包括：残基图和原子图，模型采用几何向量感知器，构建了基于GVP的图神经网络来学习残基图和原子图上两个尺度的信息来进行预测。模型的主要流程包括：层次图构建、特征学习、信息聚合。最终，聚合后的节点特征被输入到预测层，以生成位点预测结果。实验结果表明，与其他基于蛋白质结构和蛋白质序列的预测方法相比，该模型在准确度、精确度、召回率、F1分数、马修斯相关系数、接收者操作特征曲线下面积以及精确召回曲线下的面积等评估指标上均达到较好的效果。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业 生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||
