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专利号 2020100214862 申请日 2020-01-09 专利名称 基于stacking集成的RNA中N6-甲基腺苷修饰位点预测方法
授权日 2023-02-03 专利权人 青岛科技大学 发明人 于彬;禹昭敏;王磊;陈瑞欣
主分类号 G16B15/30 关键词 应用领域
摘要 本发明公开了基于stacking集成的RNA中N6‑甲基腺苷修饰位点预测方法,涉及系统生物学领域。通过6种特征提取方法提取酿酒酵母、智人和拟南芥3个物种的RNA序列特征,通过特征融合得到原始数据集的初始特征空间;利用弹性网络对其进行降维,剔除冗余、噪声特征,保留对模型分类相关的重要特征,得到最佳特征集合;把最优特征子集以及所对应的类别标签输入到stacking集成中进行模型训练,并结合评价指标评估模型的预测性能,得到预测模型;将测试集中待预测的RNA序列,输入至预测模型中,预测m6A位点并输出。此模型在测试集上的预测准确率分别达到92.30%和87.06%,在跨物种预测方面具有很好的发展潜力,可成为鉴定m6A位点的有用工具。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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