| 专利号 | 2020100214862 | 申请日 | 2020-01-09 | 专利名称 | 基于stacking集成的RNA中N6-甲基腺苷修饰位点预测方法 |
| 授权日 | 2023-02-03 | 专利权人 | 青岛科技大学 | 发明人 | 于彬;禹昭敏;王磊;陈瑞欣 |
| 主分类号 | G16B15/30 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明公开了基于stacking集成的RNA中N6‑甲基腺苷修饰位点预测方法,涉及系统生物学领域。通过6种特征提取方法提取酿酒酵母、智人和拟南芥3个物种的RNA序列特征,通过特征融合得到原始数据集的初始特征空间;利用弹性网络对其进行降维,剔除冗余、噪声特征,保留对模型分类相关的重要特征,得到最佳特征集合;把最优特征子集以及所对应的类别标签输入到stacking集成中进行模型训练,并结合评价指标评估模型的预测性能,得到预测模型;将测试集中待预测的RNA序列,输入至预测模型中,预测m6A位点并输出。此模型在测试集上的预测准确率分别达到92.30%和87.06%,在跨物种预测方面具有很好的发展潜力,可成为鉴定m6A位点的有用工具。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业  生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||