| 专利号 | 2021109066729 | 申请日 | 2021-08-09 | 专利名称 | 一种预测蛋白质-多肽结合位点的方法及系统 |
| 授权日 | 2022-11-29 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 魏乐义;王汝恒;崔立真;苏苒 |
| 主分类号 | G16B15/20 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明公开了一种预测蛋白质‑多肽结合位点的方法及系统，包括：获取待预测的蛋白质‑多肽序列数据，将所述数据输入到训练好的基于预训练模型BERT和对比学习的神经网络模型，输出位点级别的多肽结合概率，并确定输入序列中的各个位点是否结合；其中，所述基于预训练模型BERT和对比学习的神经网络模型首先将原始蛋白质‑多肽序列中的每个氨基酸转换为嵌入矩阵，所述嵌入矩阵经过BERT编码和全连接神经网络层，得到每个氨基酸的低维表示矩阵；进行BERT编码时，通过构建对比损失进行约束，生成具有区分性的结合与非结合位点表示特征。本发明使用预训练模型BERT作为对原始蛋白质序列的编码器，可以自动提取特征，从而避免由预测工具所带来的问题。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业 生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||
