| 专利号 | 2023116850556 | 申请日 | 2023-12-11 | 专利名称 | 一种空间转录组测序方法、系统、介质及设备 |
| 授权日 | 2024-03-19 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 殷泽坤;常启鑫;闫立峰;刘卫国 |
| 主分类号 | G16B30/00 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明属于基因测序数据处理领域,提供了一种空间转录组测序方法、系统、介质及设备,其技术方案为:消费者线程按块读取barcode位置信息文件,基于barcode位置信息文件构建map数据结构;生产者线程按块读取fastq测序数据,将读取的数据转化read格式放入数据块队列中;消费者线程从数据块队列获取数据块,解析出read,对于每条read,使用构建好的map数据结构查询read的位置,如果未查询到,进行容错处理后再查询,将查询得到的相应的位置对应的read交给写线程,仍未查询到,直接丢弃。解决了生产者线程读取速度过快,造成的负载不均衡的问题。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 生物产业  生物医学工程产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||