一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法

专利号	2024107483798	申请日	2024-06-12	专利名称	一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法
授权日	2024-09-13	专利权人	齐鲁工业大学(山东省科学院)	发明人	董祥军;董淑杰;赵龙;鹿文鹏
主分类号	G16B30/00	关键词		应用领域
摘要	本发明公开了一种用于单细胞测序数据的缺失值插补方法，涉及单细胞RNA测序数据测序技术领域。本发明包括如下步骤：S1、构建原始基因表达矩阵V，对V进行归一化处理而后分别进行两次遮蔽操作，得到原始遮蔽基因矩阵X1和X2，而后，基于X1和X2分别生成细胞图A1和A2；S2、构建图对比学习重构网络，得到插补后的基因表达矩阵；S3、构建图对比学习重构网络的总损失；S4、基于总损失L训练图对比学习重构网络；S5、将单细胞测序数据按照步骤S1获取X1、X2、A1和A2，而后将其输入至模型中，前向传播一次，得到插补后的基因表达矩阵。本申请得到的插补后的基因表达矩阵，在细胞聚类、细胞轨迹重建任务中都有较佳表现。
创新点
技术分类		标签		战兴产业	生物产业生物医学工程产业
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