| 专利号 | 2020102133573 | 申请日 | 2020-03-24 | 专利名称 | 基于众核平台上面向二代测序数据的序列比对方法及系统 |
| 授权日 | 2022-09-27 | 专利权人 | 山东大学 | 发明人 | 刘卫国;张金潇;殷泽坤;刘美洋;张雯 |
| 主分类号 | G06F9/30 | 关键词 | 应用领域 | ||
| 摘要 | 本发明公开了基于众核平台上面向二代测序数据的序列比对方法及系统，包括：根据平台计算能力，自适应的调整读入的数据块大小，实现计算与I/O的相互掩盖；基于内存池策略利用预分配策略和轻量级的内存分配策略，减小内存开销；充分利用处理器的向量处理单元，采用指令集对计算过程进行向量化并行。对于BWA‑MEM算法，其整体性能有了显著提升，程序整体性能取得了3.62倍的加速比；算法线程拓展性有了显著改善；核心计算部分相比与原算法，在不同大小的数据集下取得的加速比情况为8.4～12.6。 | ||||
| 创新点 | |||||
| 技术分类 | 标 签 | 战兴产业 | 新一代信息技术 下一代信息网络产业 | ||
| 运营方式 | 合作方式 | ||||
| 联系人 | 联系电话 | 电子邮箱 | |||
| 详细说明 | |||||
