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专利号 2024104304885 申请日 2024-04-11 专利名称 基于社区发现的多层次染色质拓扑结构域识别方法及系统
授权日 2024-07-16 专利权人 山东大学 发明人 柳军涛;刘洋洋
主分类号 G16B30/10 关键词 应用领域
摘要 本公开提供了基于社区发现的多层次染色质拓扑结构域识别方法及系统,涉及生物基因识别技术领域,包括:获取染色体测序的原始Hi‑C接触矩阵,对所述Hi‑C接触矩阵预处理后,得到无向加权子网络;利用社群发现算法将无向加权子网络划分为相互独立的社区,搜索所有社区中的候选双边界并组成集合;提取候选双边界的边界局部特征表示,并将所述边界局部特征表示输入至MLP模型中,得到每个候选双边界的预测得分;根据所述预测得分,筛选出需要保留的候选双边界,被保留下的候选双边界组成可靠边界集;对所述可靠边界集中的候选双边界进行搜索,识别形成多层级的染色体拓扑结构域TAD。
创新点
技术分类 标 签 战兴产业 生物产业    生物医学工程产业
运营方式 合作方式
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